주요 등장인물: 인디아나 존스, 헨리 존스, 엘사 슈나이더, 살라, 월터 도노번, 포겔 대령, 성배의 기사
줄거리: 영화는 월터 도노번이 인디아나에게 성배를 찾아달라고 부탁하는 장면으로 시작한다. 도노번은 그의 아버지(헨리)에게 이전에 같은 부탁을 했지만 실종됐다는 언급을 한다. 존스는 베네치아로 떠나 거기에서 엘사를 만난다. 이들은 함께 숨겨진 기사의 무덤을 찾아 알렉산드레타로 이끄는 실마리를 발견한다. 엘사와 인디아나는 브룬발트 성에서 인디의 아버지를 구출하지만 직후 포겔 대령에게 사로잡힌다. 엘사는 자신이 스파이임을 밝힌다. 인디와 헨리는 도망치고, 살라와 만나 알렉산드레타로 가는 길에 나치군과 싸워 포겔 대령을 물리친다. 성배가 보관된 신전에서, 도노번은 자기가 변절자였음을 드러내며 인디의 아버지를 쏴 인디가 아버지를 구하기 위해 세 관문을 통과하게끔 한다. 인디가 세 관문을 통과하자 엘사와 도노번이 그 뒤를 따른다. 인디는 성배의 기사와 만나 올바른 성배를 골라야만 하며, 성배는 신전 밖으로 가지고 나갈 수 없다는 말을 듣는다. 도노번이 나타나고, 엘사가 그를 부추겨 틀린 성배를 골라 죽게 만든다. 인디는 올바른 성배를 선택해 그것으로 아버지를 치료한다. 엘사는 성배를 들고 신전을 빠져나가려 하나, 신전이 무너지며 그녀 자신도 죽는다. 인디와 그의 아버지, 살라는 함께 석양을 향해 말을 달린다.
눈에 띄는 차이점: 마커스 브로디와 카짐이 없으며, 십자도 형제단 관련 서브플롯 또한 사라졌다. 헨리의 일기장에 대한 언급은 아예 존재하지 않는데, 일행은 일기장을 되찾으러 베를린으로 가지도 않고 비행선을 타고 독일을 빠져나오지도 않는다. 시작 장면 전체(인디가 어린 시절에, 그리고 어른이 되어 코로나도의 십자가를 뒤쫓는 부분)가 삭제되었다. 대화 또한 불필요한 부분이 대부분 삭제되어 많은 부분이 상당히 간략화되었다.
상영시간: 85분
주요 등장인물: 인디아나 존스, 헨리 존스, 엘사 슈나이더, 포겔 대령, 성배의 기사
줄거리: 영화는 인디아나가 베네치아에서 엘사를 만나는 장면에서 시작한다. 그곳에서 둘은 숨겨진 기사의 무덤을 발견하고 성배가 알렉산드레타에 있음을 알게 된다. 이들은 브룬발트 성에서 인디의 아버지를 구해내기로 하지만, 엘사가 배신하여 둘을 포겔 대령에게 넘긴다. 일행은 알렉산드레타로 도망친다. 인디가 신전에 도착하자, 포겔 대령이 월터 도노번을 대신하여 인디의 아버지를 쏘고 성배가 있는 방까지 인디를 따라간다 (그리고 엘사의 꾀임에 넘어가 틀린 성배를 고른다). 엘사는 다시 한 번 성배를 들고 신전 밖으로 나가려 하나, 신전이 무너진다. 영화는 인디와 그의 아버지가 석양을 향해 말을 달리는 장면으로 끝난다.
눈에 띄는 차이점: 월터 도노번과 살라가 없어졌고 탱크 전투도 존재하지 않는다. 세 관문은 이제 두 개가 되었다 ('신의 이름' 관문이 삭제되었다).
상영시간: 52분
주요 등장인물: 인디아나 존스, 엘사 슈나이더, 포겔 대령, 성배의 기사
줄거리: 영화는 인디아나가 베네치아에서 엘사를 만나, 성배가 있는 곳은 알렉산드레타라고 말해주는 장면으로 시작한다. 포겔 대령이 갑자기 엘사의 옷장에서 걸어나와 엘사가 배신자임을 밝힌다. 인디아나는 도망쳐 알렉산드레타로 향한다. 거기서 인디는 엘사와 포겔을 다시 만난다. 포겔은 엘사를 쏘아 인디가 성배를 회수하게끔 만든다. 인디는 성배 두 개를 들고 와 틀린 쪽을 포겔에게 건넨다 (이로 인해 포겔이 죽는다). 인디는 진짜 성배로 엘사의 생명을 회복시킨다. 엘사는 성배를 들고 나가려 하나, 신전이 무너져 죽는다. 영화는 인디아나가 혼자 석양을 향해 말을 달리는 장면으로 끝난다.
눈에 띄는 차이점: 헨리 존스가 없다. 관문은 하나밖에 존재하지 않는다 ("신뢰의 도약"). 결말부의 마지막은 훨씬 더 우울한 분위기인데, 인디아나가 엘사의 죽음 후 아무 말도 하지 않기 때문이다.
상영시간: 17분
주요 등장인물: 인디아나 존스, 엘사 슈나이더, 성배의 기사
줄거리: 영화는 인디아나가 베네치아에서 엘사를 만나, 성배가 있는 곳은 알렉산드레타라고 말해주는 장면으로 시작한다. 일행은 알렉산드레타로 떠나고, 신전에 들어가 성배의 기사에게서 성배를 회수해 온다. 엘사는 성배를 들고 나가려 하나, 그 탓에 신전이 무너져 죽게 된다. 인디아나는 혼자 석양을 향해 말을 달린다.
눈에 띄는 차이점: 포겔 대령이 사라졌다. 관문 또한 없고, 마지막 방에는 성배가 단 하나만 존재한다. 성배의 기사에게는 대사가 한 줄밖에 없는데, 성배를 들고 신전을 나갈 수는 없다는 경고를 하는 부분이다.
상영시간: 6분
주요 등장인물: 인디아나 존스, 성배의 기사
줄거리: 영화는 인디아나가 알렉산드레타의 사원에 진입하는 장면에서 시작된다. 성배의 기사를 만나자, 그는 성배는 사원에서 가지고 나갈 수 없다는 사실을 알려준다. 인디아나는 성배의 기사에게 이를 알려준 데 대한 감사 인사를 하고는, 석양을 향해 말을 달린다.
눈에 띄는 차이점: 엘사가 사라졌다. 인디의 대사는 두 줄 있고 ("성배를 찾으러 왔다", "성배에 대해 알려주어 고맙군") 성배의 기사는 한 줄 있다 ("성배는 신전에서 나가선 안 되오").
상영시간: 1분
주요 등장인물: 인디아나 존스
줄거리: 영화가 시작하며 사막에서 말을 탄 채 책을 보는 인디아나를 비춘다. 그는 책의 내용을 소리내어 읽는다. "성배는 알렉산드레타에 있는 사원 밖으로 나갈 수 없다." 인디아나는 책을 덮고, 자기 앞에 있는 사원을 바라보고는, 진지하게 고개를 끄덕인다. 그러고는 등을 돌려 석양을 향해 말을 달린다.
상영시간: 1분 미만
주요 등장인물: 인디아나 존스
줄거리: 인디아나가 석양을 향해 말을 달리는 모습으로 영화가 시작하고 끝난다.
상영시간: 15초 미만
주요 등장인물: 없음
줄거리: 영화는 검은 화면에 부드럽게 윙윙거리는 소리가 들릴 뿐이다.
상영시간: 3초